Bio 111 Enzymes [email protected]    enzymes are catalysts:   increase the rate of a specific chemical reaction.  in biology, most enzymes are proteins (a few are RNAs)    a chemical reaction, where the reactant is called the “substrate”:  substrate + enzyme <­­>  enzyme­substrate complex ­­>  product + enzyme  S + E  <­­>  S non­covalently bound to E  ­­>  P + E    enzymes increase reaction rates by lowering the activation energy “barrier” between S and P  the enzyme gives the reaction an "easier path" from S ­­> P  a path from S ­­> P that travels via a lower energy intermediate form    some mechanisms by which enzymes lower activation energy:  proper orientation of substrate molecules  "strain" covalent bonds of substrate molecule    enzymes do NOT change a reaction’s thermodynamics: ∆G is unchanged, K​  is unchanged  eq​   enzyme­catalyzed reactions have non­linear saturation kinetics, where V = f([S],  K​ ,  V​ )  m​ max​       non­protein parts of enzymes:  required for many enzymes to function  participate in the catalysis mechanism  temporarily or permanently bound to the active site of the enzyme    2+​ 2+  cofactors = metal ions, e.g. Mg​ , Fe​ used by many enzymes that catalyze redox reactions    coenzymes = non­protein organic molecules, e.g.:  vitamin B6  coenzyme A = CoA, functions as an acetyl group carrier (a carrier of a two­carbon group)  NAD, nicotinamide adenine dinucleotide, functions as an "electron carrier"   

vitamin B6

CoA

NAD